Даже не знаю что сказать, и винда может глючить и прога сама, ты и сам это знаешь. Был у меня случай не так давно менял маму на компе а этот JKEY S никак не хотел толком с лпт портом работать, причём всё остальное ок, в том числе JTAG UP. пришлось на старую мамку откатится. в твоём случае врядли плата, я больше склоняюсь винда глючит.